Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms