Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TMEM225BP0DP42 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms