Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 ZNF789-205ENST00000465438 4253 ntTSL 1 (best)9.77□□□□□ -0.853e-9■□□□□ 10.8
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PRPF4O43172 AGAP1-206ENST00000418654 826 ntTSL 38.43□□□□□ -1.065e-11■□□□□ 10.7
PRPF4O43172 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.066e-8■□□□□ 10.7
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PRPF4O43172 SEPT2-226ENST00000461048 1163 ntTSL 1 (best)20.54■□□□□ 0.881e-8■□□□□ 10.7
PRPF4O43172 SEPT2-243ENST00000494824 565 ntTSL 520.54■□□□□ 0.881e-8■□□□□ 10.7
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PRPF4O43172 SEPT2-204ENST00000391973 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.461e-8■□□□□ 10.7
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PRPF4O43172 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.053e-8■□□□□ 10.7
PRPF4O43172 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.033e-8■□□□□ 10.7
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PRPF4O43172 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.061e-6■□□□□ 10.7
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PRPF4O43172 AMD1-205ENST00000451850 3121 ntTSL 1 (best)6.51□□□□□ -1.374e-10■□□□□ 10.7
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PRPF4O43172 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.853e-6■□□□□ 10.7
PRPF4O43172 AKAP8L-220ENST00000609519 2113 ntTSL 220.15■□□□□ 0.823e-6■□□□□ 10.7
PRPF4O43172 AKAP8L-202ENST00000593845 2749 ntTSL 218.81■□□□□ 0.63e-6■□□□□ 10.7
PRPF4O43172 AKAP8L-217ENST00000600065 679 ntTSL 37.59□□□□□ -1.193e-6■□□□□ 10.7
PRPF4O43172 TERF2-209ENST00000569280 513 ntTSL 59.41□□□□□ -0.92e-7■□□□□ 10.7
PRPF4O43172 OBSL1-209ENST00000465589 571 ntTSL 318.25■□□□□ 0.513e-11■□□□□ 10.7
PRPF4O43172 ITPR2-210ENST00000545902 581 ntTSL 34.92□□□□□ -1.624e-10■□□□□ 10.7
PRPF4O43172 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.152e-6■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 RBMS1-209ENST00000474820 4016 ntTSL 1 (best)5.12□□□□□ -1.592e-6■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 RABL6-207ENST00000461992 763 ntTSL 1 (best)12.17□□□□□ -0.466e-7■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 LMBR1L-213ENST00000549730 585 ntTSL 59.63□□□□□ -0.877e-11■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 CHD4-214ENST00000545942 1317 ntTSL 1 (best)21.65■■□□□ 1.063e-6■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.325e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.965e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 LIME1-207ENST00000489212 559 ntTSL 520.07■□□□□ 0.85e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 CALR-205ENST00000587486 957 ntTSL 215.89■□□□□ 0.135e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 ILF3-212ENST00000589173 570 ntTSL 513.65□□□□□ -0.225e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 CALR-207ENST00000590325 781 ntTSL 213.57□□□□□ -0.245e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AC104452.1-208ENST00000636461 5083 ntTSL 518.66■□□□□ 0.582e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AMT-252ENST00000637821 2026 ntTSL 518.17■□□□□ 0.52e-10■□□□□ 10.6
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PRPF4O43172 AMT-251ENST00000637684 2168 ntTSL 518■□□□□ 0.472e-10■□□□□ 10.6
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