Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN8O00124 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms