Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCER2I3L3R5 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms