Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC4Q9Y296 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms