Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms