Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF8Q9UPP1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms