Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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COPS3Q9UNS2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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COPS3Q9UNS2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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COPS3Q9UNS2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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COPS3Q9UNS2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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COPS3Q9UNS2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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COPS3Q9UNS2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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COPS3Q9UNS2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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COPS3Q9UNS2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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COPS3Q9UNS2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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