Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NIT2Q9NQR4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms