Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA4BQ9NPR2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms