Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BRIP1Q9BX63 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms