Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPOQ9BU64 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPOQ9BU64 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPOQ9BU64 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPOQ9BU64 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPOQ9BU64 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPOQ9BU64 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CENPOQ9BU64 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPOQ9BU64 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms