Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms