Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SGF29Q96ES7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SGF29Q96ES7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SGF29Q96ES7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SGF29Q96ES7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SGF29Q96ES7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SGF29Q96ES7 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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