Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms