Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSRNP3Q8WYN3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms