Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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COPS9Q8WXC6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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COPS9Q8WXC6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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COPS9Q8WXC6 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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COPS9Q8WXC6 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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COPS9Q8WXC6 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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COPS9Q8WXC6 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms