Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXK0

PHC2, Polyhomeotic-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC2Q8IXK0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHC2Q8IXK0 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms