Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms