Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCK2Q16822 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms