Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SGCAQ16586 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SGCAQ16586 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SGCAQ16586 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SGCAQ16586 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SGCAQ16586 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SGCAQ16586 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SGCAQ16586 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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