Protein–RNA interactions for Protein: Q16513

PKN2, Serine/threonine-protein kinase N2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN2Q16513 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PKN2Q16513 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKN2Q16513 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms