Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1AQ15573 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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