Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHPRHQ149N8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHPRHQ149N8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
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