Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
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AP3B2Q13367 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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AP3B2Q13367 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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AP3B2Q13367 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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AP3B2Q13367 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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AP3B2Q13367 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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AP3B2Q13367 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AP3B2Q13367 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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