Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TROQ12816 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TROQ12816 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TROQ12816 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TROQ12816 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TROQ12816 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TROQ12816 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TROQ12816 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TROQ12816 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TROQ12816 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TROQ12816 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TROQ12816 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TROQ12816 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TROQ12816 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TROQ12816 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TROQ12816 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TROQ12816 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TROQ12816 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TROQ12816 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TROQ12816 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TROQ12816 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TROQ12816 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TROQ12816 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TROQ12816 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TROQ12816 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TROQ12816 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TROQ12816 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TROQ12816 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TROQ12816 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TROQ12816 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TROQ12816 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TROQ12816 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TROQ12816 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TROQ12816 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TROQ12816 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TROQ12816 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TROQ12816 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TROQ12816 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TROQ12816 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TROQ12816 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TROQ12816 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TROQ12816 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TROQ12816 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TROQ12816 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TROQ12816 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TROQ12816 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TROQ12816 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TROQ12816 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TROQ12816 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TROQ12816 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TROQ12816 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TROQ12816 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TROQ12816 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TROQ12816 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TROQ12816 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TROQ12816 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TROQ12816 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TROQ12816 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TROQ12816 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TROQ12816 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TROQ12816 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TROQ12816 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TROQ12816 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TROQ12816 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TROQ12816 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TROQ12816 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TROQ12816 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TROQ12816 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TROQ12816 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TROQ12816 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TROQ12816 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TROQ12816 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TROQ12816 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TROQ12816 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TROQ12816 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TROQ12816 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TROQ12816 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TROQ12816 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TROQ12816 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TROQ12816 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TROQ12816 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TROQ12816 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TROQ12816 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TROQ12816 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TROQ12816 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TROQ12816 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TROQ12816 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TROQ12816 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TROQ12816 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TROQ12816 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TROQ12816 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TROQ12816 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TROQ12816 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TROQ12816 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TROQ12816 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TROQ12816 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TROQ12816 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TROQ12816 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TROQ12816 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TROQ12816 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms