Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCT3P49368 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCT3P49368 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCT3P49368 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCT3P49368 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCT3P49368 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCT3P49368 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCT3P49368 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCT3P49368 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms