Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS1P48651 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms