Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTX2P32243 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTX2P32243 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
OTX2P32243 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms