Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT1P21579 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT1P21579 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT1P21579 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT1P21579 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT1P21579 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT1P21579 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT1P21579 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT1P21579 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT1P21579 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT1P21579 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT1P21579 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT1P21579 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT1P21579 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT1P21579 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT1P21579 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT1P21579 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT1P21579 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT1P21579 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT1P21579 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT1P21579 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT1P21579 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT1P21579 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT1P21579 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT1P21579 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT1P21579 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT1P21579 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT1P21579 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT1P21579 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT1P21579 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT1P21579 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT1P21579 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT1P21579 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT1P21579 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT1P21579 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT1P21579 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT1P21579 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT1P21579 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT1P21579 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT1P21579 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT1P21579 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT1P21579 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT1P21579 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT1P21579 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT1P21579 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT1P21579 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT1P21579 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT1P21579 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT1P21579 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT1P21579 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT1P21579 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT1P21579 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT1P21579 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT1P21579 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT1P21579 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT1P21579 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT1P21579 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT1P21579 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT1P21579 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT1P21579 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT1P21579 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT1P21579 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT1P21579 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT1P21579 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT1P21579 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms