Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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SPI1P17947 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SPI1P17947 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPI1P17947 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPI1P17947 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SPI1P17947 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SPI1P17947 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SPI1P17947 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SPI1P17947 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SPI1P17947 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SPI1P17947 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SPI1P17947 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SPI1P17947 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SPI1P17947 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SPI1P17947 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPI1P17947 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPI1P17947 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPI1P17947 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPI1P17947 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SPI1P17947 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPI1P17947 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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