Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFTRP13569 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CFTRP13569 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFTRP13569 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFTRP13569 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFTRP13569 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFTRP13569 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFTRP13569 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFTRP13569 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFTRP13569 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFTRP13569 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFTRP13569 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFTRP13569 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFTRP13569 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFTRP13569 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFTRP13569 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFTRP13569 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFTRP13569 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFTRP13569 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CFTRP13569 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CFTRP13569 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFTRP13569 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFTRP13569 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFTRP13569 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFTRP13569 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFTRP13569 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFTRP13569 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFTRP13569 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFTRP13569 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFTRP13569 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFTRP13569 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFTRP13569 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CFTRP13569 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFTRP13569 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFTRP13569 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFTRP13569 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CFTRP13569 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFTRP13569 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFTRP13569 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFTRP13569 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFTRP13569 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFTRP13569 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CFTRP13569 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CFTRP13569 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFTRP13569 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFTRP13569 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFTRP13569 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFTRP13569 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFTRP13569 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CFTRP13569 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFTRP13569 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFTRP13569 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFTRP13569 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFTRP13569 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFTRP13569 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFTRP13569 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CFTRP13569 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CFTRP13569 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFTRP13569 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFTRP13569 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFTRP13569 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFTRP13569 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFTRP13569 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFTRP13569 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFTRP13569 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CFTRP13569 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFTRP13569 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFTRP13569 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFTRP13569 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFTRP13569 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFTRP13569 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFTRP13569 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFTRP13569 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFTRP13569 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFTRP13569 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFTRP13569 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFTRP13569 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFTRP13569 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFTRP13569 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFTRP13569 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFTRP13569 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFTRP13569 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFTRP13569 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFTRP13569 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFTRP13569 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFTRP13569 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFTRP13569 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFTRP13569 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFTRP13569 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CFTRP13569 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFTRP13569 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFTRP13569 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CFTRP13569 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CFTRP13569 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFTRP13569 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CFTRP13569 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFTRP13569 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFTRP13569 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFTRP13569 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFTRP13569 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms