Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDH1P12830 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDH1P12830 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms