Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL6A2P12110 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL6A2P12110 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms