Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC166P0CW27 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms