Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SKAP2O75563 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms