Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSDA5PKW4 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms