Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POMPQ9Y244 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms