Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MED23Q9ULK4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MED23Q9ULK4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MED23Q9ULK4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MED23Q9ULK4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MED23Q9ULK4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MED23Q9ULK4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MED23Q9ULK4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MED23Q9ULK4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MED23Q9ULK4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MED23Q9ULK4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MED23Q9ULK4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MED23Q9ULK4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MED23Q9ULK4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MED23Q9ULK4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MED23Q9ULK4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MED23Q9ULK4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MED23Q9ULK4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MED23Q9ULK4 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MED23Q9ULK4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MED23Q9ULK4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MED23Q9ULK4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED23Q9ULK4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED23Q9ULK4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED23Q9ULK4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED23Q9ULK4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED23Q9ULK4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MED23Q9ULK4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED23Q9ULK4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED23Q9ULK4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED23Q9ULK4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED23Q9ULK4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms