Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSEQ9UL01 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms