Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP7

VN1R1, Vomeronasal type-1 receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R1Q9GZP7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VN1R1Q9GZP7 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms