Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
YTHDF1Q9BYJ9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms