Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFHD1Q9BUP0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms