Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARXQ96QS3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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