Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NSMCE2Q96MF7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms