Protein–RNA interactions for Protein: Q96EK2

PHF21B, PHD finger protein 21B, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21BQ96EK2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF21BQ96EK2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms