Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 ZEB2-234ENST00000636413 8984 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
COPS9Q8WXC6 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
COPS9Q8WXC6 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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