Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYRIPQ8NFW9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms