Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC17Q8N6Y2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms